אלון הוא חוקר במכון יונתן זקס באוניברסיטת בר־אילן, ועמית מחקר וחבר סגל במכון שלום הרטמן. עיסוקו העיקרי בפילוסופיה של משמעות החיים, במיוחד מנקודת מבט יהודית, לצד עיסוקים נוספים באתיקה ובפילוסופיה פוליטית.

הוא השלים את עבודת הדוקטור שלו במחשבת ישראל באוניברסיטה העברית בירושלים, והיה עמית פוסט־דוקטורט במחלקה לפילוסופיה באוניברסיטת חיפה. ספרו, Rabbi Yitzchak Hutner’s Theology of Meaning, יצא לאור בהוצאת De Gruyter-Brill.

מעבר לעיסוקו האקדמי, אלון פעיל בזירה האינטלקטואלית הציבורית. הוא שימש סגן עורך כתב העת השילוח – כתב עת ישראלי להגות ולמדיניות ציבורית, וכרכז המחקר של עמותת עתים הפעילה בתחום שירותי הדת בישראל. הוא חבר בצוות המומחים של פנימה ומשרד נשיא המדינה בנושא הקיטוב בישראל, וכן בפורום "מעבר לדמיון הליברלי – פורום למחשבה פוליטית" במכון ון ליר.

אלון זכה במענקים ובפרסים על עבודתו האקדמית והציבורית, בהם פרס קרן קרל בנדר לקידום השיח הפילוסופי בישראל, ומענק מקרן הזיכרון לתרבות יהודית.

שגרירם של ישראל – לזכרו של הרב יונתן זקס