בוטניקה ארכיאולוגית היא שדה מחקר בין-תחומי העוסק בזיהויים של שרידי צמחים ובניתוח המידע העולה מהם. המחקר עוסק בזיהוי צמחי מזון, עשבים רעים וצמחי בר, בהתפתחותם של מיני צמחים ושל חברות צמחים, הבנת ראשית החקלאות, שחזור הכלכלה, האקלים, הסביבה, אורח-החיים, השונוּת התרבותית של קדמונינו וכד’. תחום חדש ומתפתח שיש לנו בו שיתופי פעולה הוא חקר DNA קדום המופק מזרעים ארכיאולוגיים (aDNA).

המעבדה שלנו מתמחה בזרעים ופירות, שלרוב שורדים על-ידי פיחום, אך גם בתנאי יובש קיצוניים או טבולים במים.

הממצא מגיע מעשרות אתרים ארכאולוגיים בישראל, מנהריה בצפון ועד תמנע בדרום, ומשלל תקופות פרהיסטוריות והיסטוריות, תוך שיתוף פעולה פורה עם ארכיאולוגים, מאוניברסיטאות שונות ומרשות העתיקות. צוות המעבדה משתתף באופן פעיל בחפירות ובמיצוי החומר הבוטני בשיטות שיאפשרו את שימור הממצא הבוטני העדין וקבלת מידע נרחב אודותיו.

לאחר שלב החפירה, מתחיל השלב העיקרי של עבודת המעבדה – ניפוי ומיון הזרעים, והגדרתם. עבודה זו נעשית בעזרת בינוקולר (מיקרוסקופ סטריאוסקופי) ואוסף הזרעים שבמעבדה. ניתוח מגוון המינים שהתקבלו מהקונטקסטים שנדגמו, מאפשר לנו להכיר את הצמחים שהיו בשימוש תושבי האתר, צמחי בר וצמחי תרבות, מקומיים או זרים, והוא הבסיס למחקר. בנוסף, אנו נעזרים במידע מתחומים מקבילים, כגון: היסטוריה, גיאולוגיה, כימיה, חקר האקלים, גיאוגרפיה, זואולוגיה, DNA קדום.

אוסף הזרעים והפירות הלאומי שנמצא במעבדה הוא האוסף הגדול והשלם ביותר של הפלורה המקומית, והוא כלי העבודה המרכזי בהגדרת הצמחים הנעשית במעבדה.

כמו כן, במעבדה קיימת ספרייה מקצועית, הכוללת ספרים ומאמרים העוסקים בבוטניקה ארכיאולוגית, בוטניקה כללית, אתנוגרפיה ועוד. הספרייה כוללת את ספריית מעבדת פרופ’ כסלו, וספרים מספריית פרופ’ דני זהרי ז”ל.